단백질 슈퍼패밀리
단백질 슈퍼패밀리(영어: protein superfamily)는 공통 조상을 추론할 수 있는 단백질의 가장 큰 그룹(계통군)이다. 일반적으로 이러한 공통 조상은 서열의 유사성이 분명하지 않더라도 구조적 정렬[1] 및 기계적 유사성으로부터 추론할 수 있다.[2] 서열 상동성은 분명하지 않더라도 낮은 서열 유사성 때문에 추론할 수 있다. 슈퍼패밀리는 일반적으로 각 패밀리 내에서 서열 유사성을 보여주는 여러 단백질 패밀리를 포함한다. 단백질 클랜이라는 용어는 일반적으로 MEROPS 및 CAZy 분류 시스템을 기반으로 하는 단백질가수분해효소 및 글리코사이드 가수분해효소 슈퍼패밀리에 사용된다.[2][3]
같이 보기
[편집]각주
[편집]- ↑ Holm L, Rosenström P (July 2010). “Dali server: conservation mapping in 3D”. 《Nucleic Acids Research》 38 (Web Server issue): W545–9. doi:10.1093/nar/gkq366. PMC 2896194. PMID 20457744.
- ↑ 가 나 Rawlings ND, Barrett AJ, Bateman A (January 2012). “MEROPS: the database of proteolytic enzymes, their substrates and inhibitors”. 《Nucleic Acids Research》 40 (Database issue): D343–50. doi:10.1093/nar/gkr987. PMC 3245014. PMID 22086950.
- ↑ Henrissat B, Bairoch A (June 1996). “Updating the sequence-based classification of glycosyl hydrolases”. 《The Biochemical Journal》 316 (Pt 2): 695–6. doi:10.1042/bj3160695. PMC 1217404. PMID 8687420.